Un corso d'acqua è costituito da organismi viventi che ne popolano l'alveo, nonchè dalle sponde che fanno parte integrante dell'ecosistema fluviale. La naturalità delle sponde viene definita dalla composizione delle piante e dalle associazioni vegetali autoctone.
Fattore vegetale e animale sono spesso correlati e interdipendenti uno dall'altro.
La vegetazione ripariale stablizza l'alveo, fornisce detrito (cibo per gli organismi acquatici) limita lo sviluppo della vegetazione acquatica protegge dall'eccesso di illuminazione e riscaldamento, intercetta, filtra e depura le acque di dilavamento del suolo.
Le "alghe" (macrofite acquatiche) variano moltissimo a seconda del grado con il quale sono legate al mezzo acquatico:
1) emerse: formano il cosiddetto canneto con acque profonde max 0,5 1 metro (Typha, Phragmites
2) a foglie flottanti es. Nymphaea, profondità fino a 0,5 mt.
3) Sommerse Potamogeton fino a 10mt
4) Macrofite flottanti: vivono sopra lo specchio d'acqua es. Lemna
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